企业在人力资源公司进行管理时，通常是由人力资源专员来对人力资源公司员工的薪资进行管理，这样才能实现公司和员工之间的有效沟通。我们先来看下企业内部的流程：a、企业向员工发放薪酬并根据薪酬金额，在支付给每一位员工，然后根据每月发放的工资与当月应缴社保、公积金相挂钩。b、在人力资源专员完成工作之后，将已支付的工资进行汇总后，再扣除已缴纳社保、公积金及部分应缴地税等相关费用。

1、工资支出

按照规定发放给员工的工资，我们就需要在员工的工资条上做上记帐。在人力资源公司内部，往往会有一张管理人员工资表，人力资源专员将其每月发放给每一位员工的工资、社保、公积金、个人公积金等全部记录下来，并将此表与每一位员工的信息进行核对，并根据员工信息和相关工资表上填写工资和社保情况进行相应的明细记录。当发放完时，我们就需要对明细记录进行分析确认是否存在未发放工资。然后对于未发放工资单独进行账务处理。注意：在工资条所列明码上所显示的金额必须为整数。如果是整数且没有大于3的，在进行申报。

2、社保及公积金的缴纳

对于人力资源公司来说，它需要为每一位员工缴纳社保和公积金。为了能够让人力资源专员更好的管理好本企业员工，从而有效提高薪酬总额，所以它需要在做账时，根据员工已缴纳的各项费用分别做账：其中：——工资总额——社保缴费支出——个人住房公积金——其他费用。

3、工伤及医疗保险的赔付

在对 HR公司进行日常管理时，员工因为工作原因而受伤或是发生意外事故是不可避免的，那么企业就需要为他们提供相应的赔偿或者支付相应的补偿工作费用。人力资源专员一般会与医院进行协商，在签订相关协议之后，再根据实际情况对员工进行报销。在进行工伤保险及医疗保险报销后，则可以作为“营业成本”进行结转。再来看下员工工伤保险及医疗保险赔付金额等。社保，按照缴纳基数乘以当地社保缴纳基数计算，职工本人应缴费工资基数，个人按照缴费基数3%至5%之间确定；统筹地区缴费基数最低为本人工资基数；最高不得超过当地最低工资基数；但最低工资和上年度全国平均工资三十五倍之间的部分。基本养老金最低标准，按照当地最低水平确定；按照最低缴费基数的30%计缴。由企业缴纳税款。

4、企业所得税的缴纳与个人所得税计算

人力资源服务公司的所得税缴纳与个人所得税计算，主要是基于公司与员工之间的薪酬协议及薪酬支付。从企业所得税的计算方式来看，应纳税所得额=工资薪金所得-(1+20%)×12=6900元或扣除个人所得税(3%优惠税率除外）企业发放工资中除社保、公积金外的员工实际缴纳个人所得税金额，作为薪金所得，不需要缴纳所得税。实际需承担的义务与所实际支付薪水金额并不相符，很容易导致税务机关就其计算征收有误或不合理。而且由于工资本身已是企业所有成本费用中部分成本已经超过工资薪金所得计算标准，因此在实际纳税时无法将其从公司扣除。并且需要在发放当月将应代扣额和税率计算出来。

5、其他

如果人力资源专员已经将企业需要发放给员工的薪酬成本核算完毕后，还需要进行核算。在核算时，将人力资源专员工资支出明细列明。如果公司要进行税前扣除时，需要提供人力资源服务代理记账服务费用单以及发票等。需要注意的是，这种情况下需要在取得服务费用发票之后，才可以进行报销。同时还需要进行汇算清缴，以保证公司会计报表的真实、完整。因此人力资源公司想要为企业在招聘以及薪酬管理上进行合理合情合法的控制、管理好成本也是非常重要的环节。在人力资源公司进行业务活动时，需要注意以下几点：尽量避免企业内部因人员变动而导致费用发生；需要与公司进行成本核算。