1. 法律关系与主体不同
灵活用工涉及企业与劳动者之间的劳动关系或劳务关系，属于人力资源配置范畴。
委托代征则是税务机关与代征单位/个人之间的行政委托关系，属于税收征管行为。
2. 目的与适用场景不同
灵活用工旨在降低企业人力成本，适用于短期、临时性或季节性项目，如电商促销临时客服、技术外包等。
委托代征则用于简化零星、分散或异地税收的征缴流程，如个体工商户税款的代征。
3. 风险与责任划分不同
灵活用工中，企业需对劳动者的用工行为承担法律责任（如工伤、薪资纠纷）。
委托代征中，税务机关对代征行为负主要责任，但代征单位需合规操作以避免虚开发票等风险。
补充差异：
操作流程：灵活用工需签订劳动合同/劳务协议，而委托代征需取得税务机关授权并签订代征协议。
行业影响：灵活用工平台若不合规易引发虚开发票问题（如福建300亿案例），委托代征则更强调税收控管效率。
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